В состав института входят лаборатории: частной генетики и селекции, цитогенетики и гаметной селекции, генетики иммунитета, генофонда, биотехнологии, физиологии и биохимии, отдел научно-технической информации и маркетинга, отдел инноваций и обслуживания научно-исследовательских работ.Приоритетными задачами института является проведение фундаментальных и прикладных научных исследований в области генетики и селекции плодовых растений, разработка генетических основ селекционного процесса и методов создания доноров и новых высокопродуктивных сортов.